历史上不是葡萄牙而是西班牙征服了加那利群岛。1420~1479年,葡萄牙军队侵占戈梅拉岛。1479年阿尔卡索瓦条约将该群岛主权划归西班牙。至1496年,西班牙征服了其他岛屿。加那利群岛群岛原为西班牙的直辖省。
1927年西班牙政府将该群岛分为两个省。拉斯帕尔马斯省管辖大加那利岛、富埃特文图拉岛、兰萨罗特岛及3个小岛;圣克鲁斯-德特内里费省管辖特内里费岛、帕尔马岛、戈梅拉岛和费罗岛。
1497年起沦为西班牙殖民地。1927年被划为西班牙的两个省:西部名圣克鲁斯特内里费省,东部名拉斯帕耳马斯省。群岛于1982年8月10日根据自治法设为自治区。加那利群岛的原始居民为柏柏尔(Berber)族的关切人,现已灭绝。柏柏尔人15世纪时为西班牙人征服。约西元前40年,茅利塔尼亚国王朱巴二世(Juba Ⅱ)远征至此,罗马人由此得知有加那利群岛。朱巴所述此事在古典作家普卢塔克(Plutarch)和老普林尼(Pliny the Elder)的著作中保存有记录。老普林尼提到:“加那利之名称来自当地有众多体型巨大的狗(canes)。”